Extracción de conocimiento útil en biomedicina mediante técnicas de minería de patrones

• Autores: Antonio Manuel Trasierras Fresco
• Directores de la Tesis: Sebastián Ventura Soto (dir. tes.) , José María Luna Ariza (codir. tes.)
• Lectura: En la Universidad de Córdoba (ESP) ( España ) en 2023
• Idioma: español
• Tribunal Calificador de la Tesis: Ernestina Menasalvas (presid.) , Cristóbal Romero Morales (secret.) , Alejandro Rodríguez Gonzalez (voc.)
• Enlaces
  • Tesis en acceso abierto en: Helvia
• Resumen

  • La tarea de deteccion de de caracteristicas comunes y unicas de los pacientes aquejados por el cancer constituye uno de los principales focos de investigacion en la actualidad cuyo objetivo es mejorar las terapias personalizadas contra la enfermedad. Sin embargo, mientras que muchas de las propuestas actuales basan su metodologia en aproximaciones predictivas, este estudio propone una aproximacion descriptiva para mejorar la comprensión de los mecanismos moleculares que dan lugar al cancer. Esta aproximacion no requiere de conocimiento previo y es capaz de capturar relaciones genicas de alto orden a partir de datos de origen transcriptomico. En este sentido, es posible obtener el conjunto de rutas de senalizacion afectadas por la enfermedad, ademas de informacion complementaria como la prognosis de los pacientes a traves de analisis adicionales aplicados sobre el conjunto de soluciones obtenidas. Para ello, tras una introduccion al estudio omico del cancer y la presentacion de las técnicas de analisis de datos empleadas, se propone una metodologia basada en la mineria de patrones para el estudio transcriptomico de la enfermedad bajo dos tecnicas pertenecientes al dominio de la mineria de patrones descriptiva supervisada. Cada una de estas aplicaciones compone un capitulo del presente estudio, estando el primero destinado al tipo de análisis mas comun realizado sobre cualquier estudio omico (y por consiguiente en cancer): caso vs control. En este capitulo, se detalla una metodologia basada en el uso de técnicas de mineria de patrones emergentes para el estudio descriptivo y discriminatorio de la enfermedad. Los resultados obtenidos, tal y como se detallan en el capitulo, presentan un especial interes debido a que ofrecen tanto informacion contrastada (ideal para validar la metodologia) como informacion novedosa en forma de relaciones de alto orden. El segundo capitulo extiende el concepto de las tecnicas de analisis descriptivas discriminatorias a varias condiciones, en este caso al estudio de varios subtipos de cancer. Para ello, en esta ocasion se hace uso de tecnicas de mineria de patrones de contraste. Como valor anadido, este capitulo discute las implicaciones de los resultados obtenidos sobre la supervivencia de los pacientes aquejados por la enfermedad.