Reconocimiento de Perfiles de Regulación Genética mediante Algoritmos Evolutivos Multiobjetivo

• Autores: Rocío C. Romero Zaliz
• Directores de la Tesis: Óscar Cordón García (dir. tes.) , Jorge Sergio Igor Zwir Nawrocki (dir. tes.)
• Lectura: En la Universidad de Granada ( España ) en 2005
• Idioma: español
• Número de páginas: 196
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  • Tesis en acceso abierto en: DIGIBUG
• Resumen

  • Para desarrollar los objetivos planteados, la memoria está organizada en cinco capítulos, una sección de comentarios finales y un apéndice. La estructura de cada una de estas partes se comentará brevemente a continuación. En el Capítulo 1, se introduce al lector a los conceptos básicos de biología molecular, los cuales serán necesarios para la adecuada comprensión de los capítulos posteriores. Se comienza con una breve descripción de los componentes principales de los organismos vivientes, siguiendo por los procesos necesarios para el mantenimiento de la vida, y finalizando con una breve reseña cerca de los métodos biológicos para el estudio de secuencias de ADN. Adicionalmente, se introduce la Bioinformática, una disciplina moderna y en pleno apogeo, conjuntamente con los problemas clásicos que ésta abarca. En el Capítulo 2, se presentan las diferentes técnicas y métodos sobre los cuales se basa la metodología principal propuesta en esta memoria. Los temas tratados en este capítulo son: el modelado o la identificación de sistemas, la lógica difusa, el clustering (agrupamiento) de conjuntos de datos, en particular el clustering conceptual, y los algoritmos evolutivos, con especial atención a la programación genética y a las técnicas de optimización multiobjetivo. En el Capitulo 3, se explica en detalle la metodología propuesta para poder abordar los objetivos comentados anteriormente. Se comienza mostrando el esquema general, para luego desarrollar cada uno de los pasos que la componen. Para una mayor comprensión de la misma, se acompaña cada etapa con ejemplos realizados sobre un dominio sencillo. En el Capítulo 4, se aplica la metodología propuesta a un problema sobre organismos procariotas, el estudio de la regulación genética en los organismos de E. coli y Salmonella. En las diferentes secciones que componen este capítulo, se explica como se ha adaptado la metodología general al problema específico, destacando especialmente el proceso de construcción y modelado del conjunto de datos utilizado. Finalmente, se validarán los resultados obtenidos comparándolos con datos experimentales. En el Capítulo 5, se aplica la metodología propuesta a un problema sobre organismos eucariotas, un estudio de la respuesta genética a procesos inflamatorios en seres humanos. En las diferentes secciones que componen este capítulo, se explica como se ha adaptado la metodología general al problema específico, desde la construcción de la base de datos hasta el proceso final de predicción sobre nuevos genes. Incluimos luego una sección de “Comentarios Finales”, que resume los resultados obtenidos en esta memoria, presentando algunas conclusiones sobre los mismos. Finalmente, se comentarán algunos aspectos sobre trabajos futuros que quedan abiertos en la presente memoria. Por ultimo, incluiremos también un apéndice donde se presentaran tablas y figuras adicionales asociadas a las dos aplicaciones de la metodología.