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Análisis de textos sobre interacciones entre proteínas

  • Autores: Roxana María Danger Mercaderes Árbol académico, Ferrán Pla Árbol académico, Antonio Molina Marco
  • Localización: Procesamiento del lenguaje natural, ISSN 1135-5948, Nº. 45, 2010, págs. 301-302
  • Idioma: español
  • Títulos paralelos:
    • Protein-Protein Interaction text analysis
  • Enlaces
  • Resumen
    • español

      Por su enorme interés en la genética, medicina y farmacología, detectar interacciones entre proteínas (PPI) es una de las áreas de investigación más importantes en el campo de las investigaciones biomédicas. De ahí que revista especial importancia el análisis (semi) automático de textos biomédicos que permita recuperar y mantener descripciones experimentales que justifican la presencia o ausencia tales interaccione. Tal es la finalidad del sistema on-line que se describe en el presente trabajo: dado un texto, se verifica su afinidad al tema sobre PPI, y varias entidades biomédicas son reconocidas y devueltas al usuario.

    • English

      Protein-Protein Interaction (PPI) is one of the most important fields in biomedical research due to its enormous interest in genetics, medicine and pharmacology. Therefore, (semi)-automatic analysis of biomedical texts is critical for recovering and maintaining experimental descriptions which justify the presence or absence of such interactions. In this paper, an automatic, on-line system is described which, given a text, verifies if it corresponds to a PPI article, and recognizes various types of entities associated to this research context.

  • Referencias bibliográficas
    • Hirschman L., Yeh A., Blaschke C., Valencia A. 2005. Overview of BioCreAtIvE: critical assessment of information extraction for biology BMC...
    • Krallinger M., Morgan A., Smith L., Leitner F., Tanabe L., Wilbur J., Hirschman L., Valencia A.. 2008. Evaluation of text-mining systems for...
    • Leitner F., Krallinger M., Valencia A. 2009. The BioCreative II.5 Online Challenge. http://www.biocreative.org/media/store/files/ 2009/The_BioCreative_II.5_Online_Challen ge.pdf.

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