Ir al contenido

Documat


Cytoscape: guía de iniciación al desarrollo

  • Autores: Juan J. Díaz-Montaña
  • Localización: MoleQla: revista de Ciencias de la Universidad Pablo de Olavide, ISSN-e 2173-0903, Nº. 14, 2014, 5 págs.
  • Idioma: español
  • Enlaces
  • Resumen
    • Cytoscape es una de las aplicaciones más usadas para la visualización y análisis de redes biológicas poseyendo una enorme comunidad tanto de usuarios como de desarrolladores. Este artículo pretende mostrar una visión general de Cytoscape y su evolución, así como presentar una introducción al desarrollo de apps. De esta forma, en el presente documento se abordará de forma ordenada qué pasos hay que seguir para el correcto desarrollo de apps, referenciando en todo momento en donde se puede ampliar la información que aquí se recoge. Note que este artículo no pretende ser un tutorial o manual de usuario ya que los susodichos pueden encontrarse en la web de Cytoscape (http://www.cytoscape.org)

  • Referencias bibliográficas
    • D. Eisenberg, E. M. Marcotte, I. Xenarios, and T. O. Yeates, “Protein function in the post-genomic era.” Nature, vol. 405(6788), pp. 823–6.,...
    • G. W. Bell and F. Lewitter, Methods in Enzymology, 2006, ch. Visualizing Networks, pp. 408–421.
    • P. Shannon, A. Markiel, O. Ozier, N. S. Baliga, J. T. Wang, D. Ramage, N. Amin, B. Schwikowski, and T. Ideker, “Cytoscape: A software environment...
    • S. Killcoyne, G. W. Carter, J. Smith, and B. John, Protein Networks and Pathway Analysis. Methods in Molecular Biology, 2009, ch. Cytoscape:...
    • R. C. e. a. Gentleman, “Bioconductor: open software development for computational biology and bioinformatics,” Genome Biology, vol. 5, 2004....
    • P. T. Shannon, M. Grimes, B. Kutlu, J. J. Bot, and D. J. Galas, “Rcytoscape: tools for exploratory network analysis,” BMC Bioinformatics,...
    • R. e. a. Saito, “A travel guide to cytoscape plugins,” Nature Methods, vol. 9, pp. 1069–1076, 2012.
    • C. T. Lopes, M. Franz, F. K. S. L. D. Q. Morris, and G. D. Bader, “Cytoscape web: an interactive web-based network browser,” BMC Bioinformatics,...
    • D. Ma, “Services computing, 2007. scc 2007. ieee international conference on,” in Services Computing, 2007. SCC 2007. IEEE International Conference...

Fundación Dialnet

Mi Documat

Opciones de artículo

Opciones de compartir

Opciones de entorno