Estudio del uso de Ontologías para la Expansión de Consultas en Recuperación de Imágenes en el Dominio Biomédico

• Autores: Manuel Jesús Maña López , Mariano Crespo, Jacinto Mata Vázquez
• Localización: Procesamiento del lenguaje natural, ISSN 1135-5948, Nº. 47, 2011, págs. 39-46
• Idioma: inglés
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• Resumen
  • español

    La existencia de grandes colecciones de imágenes médicas ha generado un interés cada vez mayor por el acceso a este tipo de información. En este artículo abordamos este problema desde el punto de vista de la recuperación basada en la información textual relacionada con la imagen. La hipótesis inicial planteada es que la expansión de las consultas podría mejorar la efectividad de un sistema de recuperación de imágenes. Se han utilizado diferentes elementos de información contenidos en las ontologías MeSH y UMLS. La expansión se ha llevado a cabo tanto a nivel de término como de concepto. Para la experimentación se ha utilizado la colección de documentos ImageCLEF del año 2009. Los resultados obtenidos muestran un ligero incremento de la medida MAP y una diferencia más significativa cuando la evaluación se realiza usando la medida F. La conclusión final es que la expansión de consulta no es suficiente para conseguir una mejora sustancial de la efectividad en este tipo de sistemas de recuperación de información.

  • English

    The existence of huge collections of medical images in scientific repositories and hospital databases has generated increasing interest in the access to this information. In this paper we address this problem focusing on image retrieval based on textual information related to the image. The initial hypothesis is that query expansion could improve the effectiveness of image retrieval systems. In this proposal, we have used several information elements contained in MeSH and UMLS ontologies. The expansion has been carried out at both term and concept levels. For the experiment we have used the document collection ImageCLEF 2009. The results show a slight increase in MAP and a more significant difference when the evaluation is performed using the F-measure. The final conclusion is that the query expansion is not sufficient to achieve a substantial improvement in the effectiveness of this type of information retrieval systems.

• Referencias bibliográficas
  • Bodenreider, O. 2004. The Unified Medical Language System (UMLS): integrating biomedical terminology. Nucleic Acids Research, 32(2004) 267–270.
  • Díaz, M.C., M.A. García, M.T. Martín, L.A. Ureña y A. Montejo. 2009a. Query Expansion on Medical Image Retrieval: MeSH vs. UMLS. Evaluating...
  • Díaz, M.C., M.T. Martín y L.A. Ureña. 2009b. Query expansion with a medical ontology to improve a multimodal information retrieval. Computers...
  • Hearst, M., A. Divoli, H. Guturu, A. Ksikes, P. Nakov, M.A. Wooldridge y J. Ye. 2007. BioText Search Engine: beyond abstract search. Bioinformatics...
  • Jimeno, A., R. Berlanga y D. Rebholz. 2010. Ontology refinement for improved information retrieval. Information Processing & Management,...
  • Kahn, C.H. Jr. y C. Thao. 2007. GoldMiner: A Radiology Image Search Engine. American Journal of Roentgenology 188:1475-1478.
  • Lu, Z., W. Kim y W. Wilbur. 2009. Evaluation of query expansion using MeSH in PubMed. Information Retrieval, Vol. 12, No. 1, pp.69-80.
  • Müller, H., J. Kalpathy–Cramer, I. Eggel, S. Bedrick, S. Radhouani, B. Bakke, C.E. Kahn y W. Hersh. 2010. Overview of the CLEF 2009 Medical...
  • Nelson, S.J., D. Johnston y B.L. Humphreys. 2001. Relationships in medical subject headings. Relationships in the Organization of Knowledge....
  • Nelson, S.J., M. Schopen, A.G. Savage, J.L. Schulman y N. Arluk. 2004. The MeSH translation maintenance system: structure, interface, design...
  • Stevens, R., C.A. Goble y S. Bechhofer. 2000. Ontology-based knowledge representation for bioinformatics. Brief Bioinformatics 1(4), pp. 398-414.
  • Xu, S., J. McCusker y M. Krauthammer. 2008. Yale Image Finder (YIF): a new search engine for retrieving biomedical images. Bioinformatics...