Utilización de algoritmos de Global Testing para validar grupos de genes significativos asignables a respuestas clínicas
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Autores: Javier de las Rivas Sanz
, Celia Fontanillo Fontanillo, Jesús María Hernández Rivas, María Jesús Rivas López , Ana Rodríguez Vicente, José Manuel Sánchez Santos
- Localización: XXXI Congreso Nacional de Estadística e Investigación Operativa ; V Jornadas de Estadística Pública: Murcia, 10-13 de febrero de 2009 : Libro de Actas, 2009, ISBN 978-84-691-8159-1
- Idioma: español
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Resumen
Global Testing es un algoritmo estadstico para comprobar la asociacion de variables a un factor o condicion de respuesta en un conjunto de muestras. Se utiliza en estudios genomicos con microarrays para determinar si el per l de expresion genica de un grupo de genes esta signi cativamente asociado a un factor o condicion clnica de interes. Los grupos de genes, de cualquier tama~no, son elegidos a priori segun patrones, anotaciones o criterios conocidos. Se basa en modelos lineales generalizados que usan funciones enlace cuya eleccion depende de la naturaleza de la respuesta clnica objeto del estudio. En este trabajo presentamos un analisis de los parametros del algoritmo y lo aplicamos de modo concreto a un conjunto de datos de 31 microarrays de pacientes con Leucemia Linfatica Cronica (CLL) sobre varias condiciones clnicas de interes: metodo de procesamiento de la muestra, procedencia (medula osea o sangre periferica), perdida de parte del cromosoma 13, pronostico.
