Developments in probabilistic graphical models: circular distributions and theory of random forests with applications in neuroscience

• Autores: Pablo Fernández González
• Directores de la Tesis: Pedro Larrañaga Múgica (dir. tes.) , Concha Bielza Lozoya (codir. tes.)
• Lectura: En la Universidad Politécnica de Madrid ( España ) en 2019
• Idioma: inglés
• Tribunal Calificador de la Tesis: Luis Baumela Molina (presid.) , Juan Antonio Fernández del Pozo de Salamanca (secret.) , José Hernandez Orallo (voc.) , César Hervás Martínez (voc.) , Juan José Rodríguez Diez (voc.)
• Enlaces
  • Tesis en acceso abierto en: Archivo Digital UPM
• Resumen

  • En inteligencia artificial, la disciplina del aprendizaje automático se ha instaurado como el buque insignia del campo de estudio. La era del Big data, en la que volúmenes cada vez mayores de datos son accesibles por el público general, requiere de herramientas que sean capaces de concisarlos y manipularlos correctamente. Por este motivo, en la actuallidad se están invirtiendo notables esfuerzos para el desarrollo de nuevos métodos para el aprendizaje y detección de patrones en los datos. En este entorno, técnicas como las redes bayesianas y los bosques aleatorios atesoran éxito a nivel de aplicación. Sin embargo, desarrollos teóricos para el campo en general y para muchos métodos en particular son menos abundantes, y el consenso general es que aún no entendemos muchos aspectos de porqué funcionan los mejores algoritmos. En esta disertación, exploramos tanto la vertiente teórica como la práctica del aprendizaje automático con un enfoque multienfático que cubre varias tecnologías.

    Para la vertiente más teórica, nuestras contribuciones abarcan dos ramas: Estadística pura y teoría de bosques aleatorios.

    En el primer caso desarrollamos la distribución de probabilidad circular von Mises truncada univariante y bivariante. Estas distribuciones pueden ser entendidas como una generalización de la conocida distribucion von Mises, que implica la adicción de dos o cuatro nuevos parámetros en el caso de la univariante o bivariante, respectivamente. Las contribuciones incluyen la definición, propiedades de la distribución y estimadores de máxima verosimilitud para los casos univariante y bivariante. Adicionalmente, el análisis del caso bivariante muestra cómo la distribución condicionada es una distribución von Mises truncada, mientras que la marginal es una generalización de la marginal no truncada. También mostramos su rendimiento a la hora de modelar datos sobre los ángulos de inclinación de las hojas.

    En el segundo caso abordamos el problema de bosques aleatorios para regresión expresados como sumas de puntos. Estudiamos el comportamiento teórico de los k-vecinos potenciales más cercanos bajo agregación de muestras bootstrap (bagging) y obtenemos una cota superior en los pesos de un punto para bosques aleatorios equipados con cualquier tipo de regla de corte (splitting criterion), si utilizamos árboles sin poda que dejan de crecer cuando hay k o menos puntos en sus hojas. Además, utilizamos la cota anterior junto con el nuevo concepto de b-terms (o términos de bootstrap) para derivar expresiones explícitas para los pesos de puntos del selector aleatorio de k-vecinos potenciales más cercanos, una estrategia de selección de puntos que también introducimos, y para construir un marco de trabajo que nos permite derivar otros estimadores que utilizan agregación de muestras bootstrap mediante un procedimiento similar. Finalmente, derivamos la expresión explícita de los pesos de un estimador de regresión equivalente a un estimador bosque aleatorio para regresión equipado con una regla de corte aleatoria y demostramos su equivalencia tanto a nivel teórico como práctico.

    Para la vertiente más práctica de esta disertación, desarrollamos dos trabajos: Un análisis estadístico que emplea la distribución von Mises truncada anteriormente definida y un clasificador multidimensional con redes bayesianas. En ambos casos, estudiamos datos neuronales en un esfuerzo por adquirir conocimiento de valor neurocientífico.

    Para el primer trabajo, analizamos ángulos de bifurcación de dendritas basales de neuronas piramidales de las capas III y V del cortex temporal humano. Para ello, utilizamos la distribución von Mises truncada, mostrando que es capaz de describir con mayor precisión los ángulos de bifurcación dendritica que anteriores propuestas. A continuación, realizamos estudios comparativos utilizando éste y otros métodos estadísticos para determinar similitudes y/o diferencias entre ramas y ángulos de bifurcación que pertenecen a diferences capas corticales y regiones, entre otras comparativas.

    Finalmente, presentamos un classificador gaussiano multidimensional clase-puente descomponible (class-bridge decomposable multidimensional Gaussian network classifier) como un modelo de alto rendimiento e interpretable, para procesar las diferencias morfológicas que existen entre diferentes neuronas cuando variamos la especie, el género, la región del cerebro, el tipo de célula y el estado de desarrollo del animal de origen, así como para tratar de avanzar en la resolución del problema de la complejidad de inferencia en clasificadores multidimensionales. Además, este trabajo incluye un algoritmo de aprendizaje de estructura que hace uso de la propiedad clase-puente descomponible para aliviar la complejidad de inferencia, que usamos para aprender estructuras de redes complejas no limitadas topológicamente que tienen en cuenta relaciones entre diferentes clases. El modelo es entrenado con datos de NeuroMorpho (v5.7) y después es utilizado para realizar predicciones precisas de todas las clases simultáneamente para nuevas muestras y, dada su interpretabilidad, para la extracción de conocimiento en neurociencia.